Angel Beats berlatar di akhirat dan berfokus pada Otonashi, seorang anak laki-laki yang kehilangan ingatannya tentang kehidupan setelah meninggal. Ia terdaftar di sekolah akhirat dan bertemu dengan seorang gadis bernama Yuri yang mengundangnya untuk bergabung dengan Afterlife Battlefront — sebuah organisasi yang dipimpinnya yang melawan Tuhan. Battlefront melawan ketua OSIS Angel, seorang gadis dengan kekuatan supranatural.
